Το όραμα του Μουσείου Ιατρικής στο Ηράκλειο, σχεδιάστηκε και αναπτύσσεται στη λογική μιας ευρύτερης αντίληψης για τον άνθρωπο και τη σχέση του με την Ιατρική και τις Επιστήμες Υγείας γενικότερα. Το Μουσείο Ιατρικής Κρήτης φιλοδοξεί να αποτελέσει ένα υποδειγματικό κέντρο διαφύλαξης, έρευνας και προβολής της Ιστορίας της Ιατρικής, από την αρχαιότητα μέχρι σήμερα. Οι συλλογές του Μουσείου που φιλοξενούνται σήμερα στην Ιατρική Σχολή περιλαμβάνουν εκατοντάδες αντικείμενα όπως, ιστορικά ιατρικά βιβλία, ιατρικά όργανα και χειρουργικά εργαλεία, παλαιά ιατρικά μηχανήματα, φαρμακευτικά σκεύη και σχετικό φωτογραφικό υλικό.